「深港通」是在深圳证券交易所及香港交易所之间建立一个交易与结算的互联互通机制。在这个机制包括「深股通」和「港股通」。
深股通，是指投资者委托本地经纪商，经由香港联合交易所设立的证券交易服务公司，向深圳证券交易所进行申报（买卖盘传递），买卖规定范围内的深圳证券交易所上市的股票。
港股通，是指投资者委托内地证券公司，经由深圳证券交易所设立的证券交易服务公司，向香港联合交易所进行申报（买卖盘传递），买卖规定范围内的香港联合交易所上市的股票。
深股通股票将在以下几种情况下被暂停买入（但允许卖出）：
(a) 该等深股不再属於有关指数成份股；及/或
(b) 该等深股指数成份股在纳入之後的定期检讨中，被认定市值少於人民币60 亿元；及/或
(c) 该等深股被实施风险警示；及/或
(d) 该等深股相应的 H 股不再在联交所挂牌买卖 （视乎何者适用）
港股通股票将在以下几种情况下被暂停买入（但允许卖出）：
(a) 其不再属於有关指数成份股；及／或
(b) 该等港股相应的A 股不再在深交所挂牌买卖或被实施风险警示；及／或
(c) 没有相应 A 股在深交所的恒生综合小型股指数(HSSI)成份股，在纳入之後的定期检讨中，市值少於港币 50 亿元；及/或
(d) 其相应的 A 股随後在深交所以外的中国内地交易所上市
本地与海外投资者可选择任何联交所参与者买卖深股通股票，惟所选的联交所参与者须符合资格参与深港通。
深港通为人民币跨境投资, 设置每日额度上限，实行实时监控。额度利用按先到先得原则。
“上限”并非指每日流入总额上限，而是每日买卖之差不能超过的上限，所有额度均是买卖对减後的净额度。每日额度每日更新及维持相同。未使用的每日额度不会结转至下一日的每日额度。
每日额度馀额 = 每日额度 － 买盘订单 ＋ 卖盘成交金额 ＋ 微调*
*每日额度馀额於下述情况下将会增加：
买盘订单被取消，或
买盘订单被对方交易所拒绝，或
买盘订单以较佳价格执行
内地投资者买卖港股通股票将以港币交易，与中国结算或其参与人则以人民币交收。
本地与海外投资者买卖深股通股票将以人民币进行交易及交收。
如每日额度馀额於开市集合竞价时段（开市前）降至零或以下，新的买盘将被驳回，直至额度馀额回复正数水平。
如每日额度馀额於连续竞价时段（连续交易）降至零或以下，日内馀下时间将不再接受买盘订单。
须注意，已获接受的买盘订单不会因每日额度用尽受影响，除非交易所参与者取消订单，否则将维持在交易所的订单纪录内。
北向交易将按照深交所的交易时间。联交所将於内地市场早市及午市开市前五分钟起接纳联交所参与者的北向订单。
| 开市集合竞价 | 09:15-09:25 | 09:10-11:30 |
| 连续竞价（早市） | 09:30-11:30 |
| 连续竞价（午市） | 13:00-14:57 | 12:55-15:00 |
| 收盘集合竞价 | 14:57 - 15:00 |
於 09:20-09: 25丶14:57-15:00，深交所不接受取消买卖盘的指令；
於 09:10-09:15丶09:25-09:30丶12:55-13:00，深交所不会处理任何指令，直至开市为止，但联交所仍接受买卖盘订单及取消买卖盘的指令；
在开市集合竞价时段未被撮合的买卖盘订单将自动进入连续竞价时段，在连续竞价时段 未被撮合的买卖盘订单将自动进入收盘集合竞价时段。
南向交易将按联交所的交易时间进行。
深港通仅在深港两地均为交易日且能够满足结算安排时开通。如果款项交收日本地市场不开市，深股通在此前一个交易日也将不开放交易。
若某一深股交易通的交易日为本地市场的半日市，深股交易通将继续开放至深交所市场收市。
| 第一天 | 营业日 | 营业日 | 开放 |
| 第二天 | 营业日 | 营业日 | 不开放 | 款项交收日
本地市场不开市 |
| 第三天 | 营业日 | 假日 | 不开放 | 本地市场不开市 |
| 第四天 | 假日 | 营业日 | 不开放 | 内地市场不开市 |
经深港通进行北向交易的相关收费及税项如下表:
| 经手费 | 成交金额 0.00487% | 双边 | 深交所 |
| 证管费 | 成交金额 0.002% | 双边 | 中国证监会 |
| 过户费 | 成交面额 0.02% | 双边 | 中国结算 |
| 成交面额 0.02% | 双边 | 本地结算 |
| 交易印花税 | 成交金额 0.1% | 卖方 | 国家税务总局 |
有待进一步与监管及税务部门确定的收费及税项如下表：
| 证券组合费 | 就深股通股票向结算参与者提供托管及代理人服务的新收费(待香港证监会批准) | 本地结算 |
| 股息红利税 | 适用於分派股息(待国家税务总局厘清) | 国家税务总局 |
| 印花税 | 适用於透过深港通买入的深股通股票(待国家税务总局厘清) | 国家税务总局 |
股息红利税将於深股通股票发行人及中国结算分派股息时预扣。证券组合费根据每名中央结算系统参与者的深股通股票的单一组合按月以港币收取。